「News」カテゴリーアーカイブ
嘉副研と山本研の合同で合宿@日光を行いました.(2022/10/28-29)

今村さん(M1)が日本機械学会 熱工学コンファレンス2022@東京に参加し,研究成果を発表しました.(2022/10/8-10/9)
渡辺さん(M1),坂本さん(M2)が第60回日本生物物理学会年会@函館に参加し,研究成果を発表しました.(2022/9/28-9/30)
Roewerさん(ドイツからの留学生)が研究室メンバーに加わりました.
佐藤さんらとの論文がInt. J. Mol. Sci.で出版されました.
Takumi Sato, Keiko Esashika, Eiji Yamamoto, Toshiharu Saiki, and Noriyoshi Arai,
“Theoretical Design of a Janus-Nanoparticle-Based Sandwich Assay for Proteins and Nucleic Acids”,
Int. J. Mol. Sci. 23, 8807 (2022).
プレスリリース「タンパク質の構造ゆらぎに注目することでタンパク質と薬の結合親和性を評価する新手法を確立-創薬研究への応用に期待-」
安田さんらとの研究が慶應義塾大学よりプレスリリースされました.
https://www.keio.ac.jp/ja/press-releases/2022/5/20/28-124022/
本研究では,分子動力学シミュレーションと機械学習手法を組み合わせることで,薬とタンパク質の結合親和性をタンパク質の構造ゆらぎから予測する新規手法を提案しました.
Nature社のCommunications Biologyに掲載されました.
<原論文情報>
Ikki Yasuda, Katsuhiro Endo, Eiji Yamamoto, Yoshinori Hirano, Kenji Yasuoka
“Differences in ligand-induced protein dynamics extracted from an unsupervised deep learning approach correlate with protein–ligand binding affinities”
Communications Biology (2022).
https://doi.org/10.1038/s42003-022-03416-7
荒井さんらとの論文をarXivにアップしました
Noriyoshi Arai, Eiji Yamamoto, Takahiro Koishi, Yoshinori Hirano, Kenji Yasuoka, and Toshikazu Ebisuzaki,
“Wetting hysteresis induces effective unidirectional water transport through a fluctuating nanochannel”,
arXiv:2204.09251.